Mikrobiologisk prøvning |
Biologiske materialer |
Spinalvæske, Podning, Serum, Plasma, Anden vævsvæske, Biopsi, Urin |
Varicella-zoster virus (VZV) DNA
|
DIR 21521 |
|
Real time PCR, multiplex
|
N/A |
VMS, Virus PCR R-238 |
Mikrobiologisk prøvning |
Biologiske materialer |
Serum, Plasma, Spinal, Urin, væv, Luftvejssekret (BAL) |
Cytomegalovirus (CMV) DNA, kvalitativ |
DIR 21521 |
|
Real time PCR |
N/A |
VMS, Virus PCR R-700 |
Mikrobiologisk prøvning |
Biologiske materialer |
BAL, Ekspektorat, Podning, Trachealsekret, Nasopharynxsekret |
Entero- og parechovirus RNA, PCR |
DIR 21521 |
|
Real-time PCR, multiplex |
N/A |
VMS, Virus PCR R-230 (også del af R-nr. 680) |
Mikrobiologisk prøvning |
Biologiske materialer |
Spinalvæske, EDTA blod, Serum, Urin, BAL, Luftvejssekter, Øjenpodninger, Podning, Biopsier, Obduktionsprøver
|
Adenovirus DNA |
DIR 21521 |
|
Real-time PCR, multiplex |
N/A |
VMS, Virus PCR R-254 (også del af R-680) |
Mikrobiologisk prøvning |
Biologiske materialer |
Serum, Plasma, Spinalvæske |
Parvovirus B19 virus DNA, PCR |
DIR 21521
|
|
Realtime PCR |
N/A |
VMS, Virus PCR R-nr. 233 |
Mikrobiologisk prøvning |
Biologiske materialer |
Fæces |
Adenovirus DNA |
DIR 21521
|
|
Real-time PCR |
N/A |
VMS, Virus PCR R-254 |
Mikrobiologisk prøvning |
Biologiske materialer |
BAL Ekspektorat Podning Trachealsekret Nasopharynxsekret |
Rhinovirus RNA |
DIR 21521 |
|
Real-time PCR, multiplex |
N/A |
VMS, Virus PCR R-274 (også del af R-680) |
Mikrobiologisk prøvning |
Biologiske materialer |
Spinalvæske, Podning, Urin, Biopsi, Serum, Anden vævsvæske, Plasma |
Herpes simplex (HSV) DNA
|
DIR 21521
|
|
Real time PCR, multiplex
|
N/A |
VMS, Virus PCR R-238 |
Mikrobiologisk prøvning |
Biologiske materialer |
BAL, Ekspektorat, Podning, Trachealsekret, Nasopharynxsekret |
Influenza A + B virus (RNA) samt typning af A |
DIR 21521 |
|
Real-time PCR, multiplex |
N/A |
VMS, Virus PCR R-299 (også del af R-680) |
Mikrobiologisk prøvning |
Biologiske materialer |
BAL,, Ekspektorat, Podning, Trachealsekret, Nasopharynxsekret |
Metapneumovirus RNA |
DIR 21521 |
|
Real-time PCR, multiplex |
N/A |
VMS, Virus PCR R-245 (også del af R-nr. 680) |
Mikrobiologisk prøvning |
Biologiske materialer |
Fæces, Serum, Spinalvæske, Urin, Vesikler, Biopsier |
Entero- og parechovirus RNA
|
DIR 21521
|
|
Realtime PCR |
N/A |
VMS, Virus PCR R-230 |
Mikrobiologisk prøvning |
Biologiske materialer |
BAL, Ekspektorat, Podning, Trachealsekret, Nasopharynxsekret |
Respiratorisk syncytialvirus (RSV) RNA |
DIR 21521 |
|
Real-time PCR, multiplex |
N/A |
VMS, Virus PCR R-297 (også del af R-680) |
Mikrobiologisk prøvning |
Biologiske materialer |
Fæces |
Sapovirus PCR |
DIR 21521 |
|
Realtime PCR |
N/A |
VMS, Virus PCR R-nr. 636 |
Mikrobiologisk prøvning |
Biologiske materialer |
BAL, Ekspektorat, Podning, Trachealsekret, Nasopharynxsekret |
Coronavirus NL63 RNA |
DIR 21521 |
|
Multiplex real-time PCR |
N/A |
VMS, Virus PCR R-2058 (også del af R-680) |
Mikrobiologisk prøvning |
Biologiske materialer |
BAL, Ekspektorat, Podning, Trachealsekret, Nasopharynxsekret |
Coronavirus HKU1 RNA |
DIR 21521 |
|
Real-time PCR, multiplex |
N/A |
VMS, Virus PCR R-2058 (også del af R-680) |
Mikrobiologisk prøvning |
Biologiske materialer |
BAL, Luftvejssekret BAL, Ekspektorat, Podning, Trachealsekret, Nasopharynxsekret |
Parainfluenza RNA, type 1, 2, 3 og 4 |
DIR 21521 |
|
Real-time PCR, multiplex |
N/A |
VMS, Virus PCR R-298 (også del af R-680) |
Mikrobiologisk prøvning |
Biologiske materialer |
BAL, Ekspektorat, Podning, Trachealsekret, Nasopharynxsekret |
Coronavirus OC43 RNA |
DIR 21521 |
|
Real-time PCR, multiplex |
N/A |
VMS, Virus PCR R-2058 (også del af R-680) |
Mikrobiologisk prøvning |
Biologiske materialer |
BAL, Ekspektorat, Podning, Trachealsekret, Nasopharynxsekret |
SARS-CoV-2 RNA |
DIR 21521 |
|
Real-time PCR, multiplex |
N/A |
VMS, Virus PCR del af R-680 |
Mikrobiologisk prøvning |
Biologiske materialer |
BAL, Ekspektorat, Podning, Trachealsekret, Nasopharynxsekret |
Coronavirus 229E RNA |
DIR 21521 |
|
Real-time PCR, multiplex |
N/A |
VMS, Virus PCR R-2058 (også del af R-680) |
Mikrobiologisk prøvning |
Biologiske materialer |
Pleuravæske, Podning fra Nasopharynx, Podning fra Pharynx, Luftvejssekret, Spinalvæske |
Mycoplasma pneumoniae DNA |
DIR 395 |
|
MPPCR Påvisning af adhesin-genet P1. Konfirmatorisk test på en anden del af P1 genet |
|
BPS PCR, R-nr.142 |
Mikrobiologisk prøvning |
Biologiske materialer |
Sekret fra nedre luftveje |
Legionella DNA |
DIR 627 |
|
LPCR:Multiplex PCR. Samtidig påvisning af Legionella spp. 16S rDNA og en sekvens af Legionella pneumophila mip-genet |
|
BPS PCR, R-nr.1320 |
Mikrobiologisk prøvning |
Biologiske materialer |
Patientmateriale fra sterile områder |
Påvisning af Mycoplasma genus DNA ved hjælp af polymerase kædereaktion (PCR): M. genus PCR |
DIR 25415 |
|
Påvisning af 16S rRNA-genet fælles for Mollicutes. Konfirmatorisk test på en anden del af 16S rRNA genet |
|
BPS PCR, R-nr.019 |
Mikrobiologisk prøvning |
Biologiske materialer |
Podning fra Nasopharynx, Podning fra Pharynx, Luftvejssekret |
Bordetella pertussis og Bordetella parapertussis DNA |
DIR 399 |
|
BPCR:Multiplex PCR detekterer IS481 fra B. pertussis og IS1001 fra B. parapertussis. Konfirmatorisk test for B. pertussis detekterer toxin gen og promotor |
|
BPS PCR, R-nr.136 |
Mikrobiologisk prøvning |
Biologiske materialer |
Podning fra Nasopharynx og Pharynx |
Chlamydia og Chlamydia pneumoniae DNA |
DIR 384 |
|
KPCR:Påvisning af 16S rRNA-genet fælles for humane chlamydia species. Konfirmatorisk test på en anden del af 16S rRNA genet |
|
BPS PCR, R-nr.113,115,117 |
Mikrobiologisk prøvning |
Biologiske materialer |
Luftvejssekret |
Pneumocystis jirovecii DNA |
DIR 400 |
|
PCPCR:Påvisning af P. jirovecii mitochondrielt rRNA-gen. Konfirmatorisk test påviser hhv. en anden del af rRNA genet og MSG genet |
|
BPS PCR, R-nr.082 |
Mikrobiologisk prøvning |
Biologiske materialer |
Podning fra henholdsvis Urethra, Rectum, Cervix og Konjunktiva. Urin. |
Chlamydia trachomatis (DNA) |
DIR 384 |
|
KPCR:Påvisning af 16S rRNA-genet fælles for humane chlamydia species. Konfirmatorisk test på plasmid sekvens |
|
BPS PCR, R-nr. 117 |
Mikrobiologisk prøvning |
Biologiske materialer |
Skrab/podninger fra urogenitale slimhinder, øjne og rectum, samt førstladt urin |
Mycoplasma genitalium DNA |
DIR 557 |
|
MGPCRPåvisning af MgPa adhesin genet for M. genitalium. Konfirmatorisk test på 23S rRNA-genet |
|
BPS PCR, R-nr. 104 |
Mikrobiologisk prøvning |
Biologiske materialer |
Forhudsskyllevæske fra tyre |
Tritrichomonas foetus |
DIR 38947 |
1. WOAH (tidligere OIE) Terrestrial Manual, Trichomonosis chapter 3.4.15
2. Improved detection of Tritrichomonas foetus in bovine diagnostic specimens
using a novel probe-based real time PCR assay. McMillen & Lew, 2006
3. Tritrichomonas - Systematics of an enigmatic genus. Frey & Muller, 2012 |
Real Time PCR, kvalitativ |
|
BPS PCR, R-nr. 9326 |
Mikrobiologisk prøvning |
Biologiske materialer |
Cellekultur, medier, vacciner |
Mycoplasma genus DNA |
DIR 25415 |
|
Real Time PCR, kvalitativ |
|
BPS PCR, R-nr.019 |
Mikrobiologisk prøvning |
Biologiske materialer |
Pleuravæske, Luftvejssekret, Spinalvæske |
Chlamydia pneumoniae (DNA) og Chlamydia trachomatis (DNA) |
DIR 384 |
|
KPCR: Påvisning af 16S rRNA-genet fælles for humane chlamydia species. Konfirmatorisk test på en anden del af 16S rRNA genet |
|
BPS PCR, R-nr.113,117 |
Mikrobiologisk prøvning |
Biologiske materialer |
Svælgsvaber, kloaksvaber, svaber prøver fra døde fugle (milt), fæces prøver fra fugle/skrab fra fuglefoder bræt eller fuglehus, væv/biopsi fra døde fugle |
Chlamydia psittasi (Ornitose) DNA |
DIR 35632 |
OIE Terrestial Manual 2021, Chapter 3.3.1 Avian Chlamydiosis (version adopted in May 2018) - MODIFICERET |
Real Time PCR, kvalitativ |
R-nr. 9068
BPS, PCR anvender metoden beskrevet af Angen et al., Diagnostic Microbiology and Infectious Disease 100(2) 2021, hvilket er et forbedret og species-specifikt alternativ til de qPCR test som OIE Manualen foreslår. |
BPS PCR, R-nr.9068 |
Mikrobiologisk prøvning |
Biologiske materialer |
Ekspektorat, trachealsekret, BAL, Podning, Podning fra svælg |
Chlamydia psittasi DNA |
DIR 384 |
|
Real Time PCR, kvalitativ |
|
BPS PCR, R-nr.115 |
Mikrobiologisk prøvning |
Biologiske materialer |
Aviær paramyxovirus type 1 virus |
Aviær paramyxovirus serotype 1 virulensbestemmelse |
DIR 35778, DIR 35779 |
EURL. OIE Manual of Diagnostic Tests and Vaccines for Terrestrial Animals 2018 |
Sekventering |
V9012 |
VMS; INF |
Mikrobiologisk prøvning |
Biologiske materialer |
Aviær influenzavirus isolat |
Aviær influenzavirus N-typning |
DIR 35772 |
NA-Fluor Influenza Neuraminidase Assay Kit, Applied Biosystems, cat.no. 4457090 |
Neuraminidase inhibitionstest |
V9025 |
VMS; INF |
Mikrobiologisk prøvning |
Biologiske materialer |
Aviær influenzavirus subtype |
Aviær influenzavirus patogenicitetsbestemmelse og subtypeverifikation |
DIR 35778, DIR 35779 |
EURL. OIE Manual of Diagnostic Tests and Vaccines for Terrestrial Animals |
Sekventering |
V9011 |
VMS; INF |
Mikrobiologisk prøvning |
Biologiske materialer |
Svaberprøver, væv, virusisolater fra fugle |
Aviær paramyxovirus serotype 1 påvisning |
DIR 35777 |
EURL. Sutton et al. 2019, J.Vir. Meth. 265, 9-14 |
RT-PCR, kvalitativ |
V9007, V9008, V9312, V9313, V9346, V9355 |
VMS; INF, Virus PCR |
Mikrobiologisk prøvning |
Biologiske materialer |
Svaberprøver, væv, virusisolater fra fugle |
Aviær influenzavirus HA-subtypning |
DIR 35775 |
EURL. OIE Manual of Diagnostic Tests and Vaccines for Terrestrial Animals. |
Hemagglutinations inhibitionstest (HI-test) |
V9023 |
VMS; INF |
Mikrobiologisk prøvning |
Biologiske materialer |
Svaberprøver, væv, virusisolater fra fugle |
Aviær paramyxovirus serotypning |
DIR 35775 |
EURL. OIE Manual of Diagnostic Tests and Vaccines for Terrestrial Animals. |
Hemagglutinations inhibitionstest (HI-test) |
V9024 |
VMS; INF |
Mikrobiologisk prøvning |
Biologiske materialer |
Svaberprøver, væv, virusisolater fra fugle |
Aviær influenzavirus påvisning og subtypning |
DIR 35777 |
EURL. OIE Manual of Diagnostic Tests and Vaccines for Terrestrial Animals.
Spackman et al. 2002.
Slomka et al. 2007, 2009, 2012.
Hoffman et al. 2016
|
RT-PCR, kvalitativ |
V9001, V9002, V9003, V9004, V9005, V9006, V9013, V9017, V9018, V9020, V9028, V9324, V9032, V9035, V9248, V9249 |
VMS; INF, Virus PCR |
Mikrobiologisk prøvning |
Biologiske materialer |
Svaberprøver, væv, virusisolater fra fugle |
Aviær influenzavirus, Aviær paramyxovirus |
DIR 35770 |
EURL. OIE Manual of Diagnostic Tests and Vaccines for Terrestrial Animals |
Dyrkning i embryonerede hønseæg |
V9022 |
VMS; INF |
Mikrobiologisk prøvning |
Biologiske materialer |
Fæces |
Påvisning af oocyster af Cryptosporidium spp. |
DIR 2123 |
|
Mikroskopi. Kvalitativ |
|
BPS, Parasitologi, R-nr. 073 |
Mikrobiologisk prøvning |
Biologiske materialer |
Fæces |
Påvisning og identifikation af cyster af tarmprotozoer, ormelarver og ormeæg |
DIR 1028 |
|
Mikroskopi. Kvalitativ |
|
BPS, Parasitologi, R-nr. 071 |
Mikrobiologisk prøvning |
Biologiske materialer |
Serum |
Påvisning af antistoffer mod Plasmodium arter (Malaria), IgG og IgM |
DIR 2122 |
|
In House; IFAT. Kvantitativ |
|
BPS, Parasitologi, R-nr. 388 |
Mikrobiologisk prøvning |
Biologiske materialer |
Forhudsskyllevæske fra tyre |
Tritrichomonas foetus |
DIR 36670 |
1. WOAH (tidligere OIE) Terrestrial Manual, Trichomonosis chapter 3.4.15
2. Improved detection of Tritrichomonas foetus in bovine diagnostic specimens using a novel probe-based real time PCR assay. McMillen & Lew, 2006
3. Tritrichomonas - Systematics of an enigmatic genus. Frey & Muller, 2012 |
Dyrkning |
|
BPS, Parasitologi, R-nr. 9326 |
Mikrobiologisk prøvning |
Biologiske materialer |
Forhudsskyllevæske fra tyre |
Tritrichomonas foetus |
DIR 36670 |
1. WOAH (tidligere OIE) Terrestrial Manual, Trichomonosis chapter 3.4.15
2. Improved detection of Tritrichomonas foetus in bovine diagnostic specimens using a novel probe-based real time PCR assay. McMillen & Lew, 2006
3. Tritrichomonas - Systematics of an enigmatic genus. Frey & Muller, 2012 |
Mikroskopi. Kvalitativ |
|
BPS, Parasitologi, R-nr. 9326 |
Mikrobiologisk prøvning |
Biologiske materialer |
Muskelprøver |
Trichinella spp |
DIR 39197 |
KOMMISSIONENS GENNEMFØRELSESFORORDNING (EU) 2015/1375, bilag 1, kapitel 1. ISO metode: DS/EN ISO 18743:2015 |
Mikroskopi. Kvantitativ |
|
BPS, Parasitology, R-nr. 9071 |
Mikrobiologisk prøvning |
Biologiske materialer |
Serum, plasma |
Toxoplasma gondii IgM og IgG antistoffer |
DIR 2089 |
|
ELFA - BioMérieux. Kvantitativ |
|
BPS, Parasitologi, R-nr. 380 |
Mikrobiologisk prøvning |
Biologiske materialer |
Serum, plasma |
Toxoplasma gondii Avidity |
DIR 761 |
|
ELFA - BioMérieux. Kvantitativ |
|
BPS, Parasitologi, R-nr. 380 |
Mikrobiologisk prøvning |
Biologiske materialer |
Orm |
Echinococcus sp. |
DIR 39327 |
WOAH Terrestrial Manual 2022: CHAPTER 3 . 1 . 6 . ECHINOCOCCOSIS (INFECTION WITH ECHINOCOCCUS GRANULOSUS AND WITH E . MULTILOCULARIS) |
Mikroskopi. Kvantitativ |
|
BPS, Parasitology, R-nr. 9072 |
Mikrobiologisk prøvning |
Biologiske materialer |
Patientprøver fra mistænkt infektiøst focus |
Påvisning af urogenitale mycoplasmer og mycoplasmainfektioner |
DIR 1990 |
|
Dyrkning på faste og flydende specialmedier |
|
BPS, Bakt. diagnostik, R-nr. 152, 141, 143, 104. |